Его называли Великим Франсуа, его игру на органе и клавесине обожали современники. Известность Куперен приобрел благодаря светским инструментальным миниатюрам, хотя также писал и духовную музыку. Всего композитор сочинил более 250 пьес для клавесина. Куперен создал свой изысканно-филигранный стиль, во многом отвечающий эстетике рококо. Здесь и безупречный вкус, и чувство меры, и обилие тонких украшений, столь подходящих для клавесинного звучания. Иоганнес Брамс называл Баха и Генделя учениками Куперена. Связи со стилем французского классика можно найти также в творчестве Гайдна и Моцарта. Позднее традиции «Великого Франсуа» возродились в произведениях французских импрессионистов — Равеля и Дебюсси.